Slovensko karitas je 1. maja 1990 ustanovila tedanja Slovenska pokrajinska škofovska konferenca. V nadaljevanju so bile ustanovljene še tri škofijske karitas.

Škofijsko karitas Ljubljana je 29. junija 1990 ustanovil takratni nadškof dr. Alojzij Šuštar. Škofijsko karitas Koper je 6. septembra 1990 ustanovil koprski škof msgr. mag. Metod Pirih. Škofijsko karitas Maribor je 12. oktobra1990 ustanovil mariborski škof dr. Franc Kramberger.

V dvajsetih letih je bilo ustanovljenih 436 župnijskih, dekanijskih in območnih Karitas. Za izvajanje specifičnih socialnih programov so bili ustanovljeni tudi trije zavodi: Zavod Pelikan Karitas, Čebela dnevno varstvo Karitas in Zavod Karitas Samarijan.

Slovenska karitas je od 10. maja 1995 polnopravna članica Caritas Internationalis in Caritas Europa.

Temelj delovanja Karitas je prostovoljno delo. V župnijskih Karitas deluje 8.158 stalnih prostovoljcev. Pridružujejo se jim številni občasni prostovoljci in dobrotniki, ki na različne načine redno podpirajo delo Karitas.